U.C.0088.1.25（格里普斯戰役末期），一部份認同迪坦斯思想的地球聯邦軍戰技教導團（專門訓練教官的部隊）官兵於小行星基地培曾組成「新迪西斯（New Decides）」組織，並發表宣言，對A.E.U.G.抗戰到底。為了討伐新迪西斯，聯邦軍臨時組織了「α任務部隊」開往培曾基地。主角「獠·魯茲」在雙方的戰鬥以及新吉翁軍的介入下，與S鋼彈的人工智慧作業系統ALICE（Advanced Logistic & Inconsequence Cognizing Equipment，「發展型邏輯／非邏輯辨識裝置」）在過程中彼此互動成長。

U.C. 0088